决策树原理:从数据集中找出决定性的特征对数据集进行迭代划分,直到某个分支下的数据都属于同一类型,或者已经遍历了所有划分数据集的特征,停止决策树算法。
每次划分数据集的特征都有很多,那么我们怎么来选择到底根据哪一个特征划分数据集呢?这里我们需要引入信息增益和信息熵的概念。
一、信息增益
划分数据集的原则是:将无序的数据变的有序。在划分数据集之前之后信息发生的变化称为信息增益。知道如何计算信息增益,我们就可以计算根据每个特征划分数据集获得的信息增益,选择信息增益最高的特征就是最好的选择。首先我们先来明确一下信息的定义:符号xi的信息定义为 l(xi)=-log2 p(xi),p(xi)为选择该类的概率。那么信息源的熵H=-∑p(xi)·log2 p(xi)。根据这个公式我们下面编写代码计算香农熵
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def calcShannonEnt(dataSet): NumEntries = len (dataSet) labelsCount = {} for i in dataSet: currentlabel = i[ - 1 ] if currentlabel not in labelsCount.keys(): labelsCount[currentlabel] = 0 labelsCount[currentlabel] + = 1 ShannonEnt = 0.0 for key in labelsCount: prob = labelsCount[key] / NumEntries ShannonEnt - = prob * log(prob, 2 ) return ShannonEnt |
上面的自定义函数我们需要在之前导入log方法,from math import log。 我们可以先用一个简单的例子来测试一下
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def createdataSet(): #dataSet = [['1','1','yes'],['1','0','no'],['0','1','no'],['0','0','no']] dataSet = [[ 1 , 1 , 'yes' ],[ 1 , 0 , 'no' ],[ 0 , 1 , 'no' ],[ 0 , 0 , 'no' ]] labels = [ 'no surfacing' , 'flippers' ] return dataSet,labels |
这里的熵为0.811,当我们增加数据的类别时,熵会增加。这里更改后的数据集的类别有三种‘yes'、‘no'、‘maybe',也就是说数据越混乱,熵就越大。
分类算法出了需要计算信息熵,还需要划分数据集。决策树算法中我们对根据每个特征划分的数据集计算一次熵,然后判断按照哪个特征划分是最好的划分方式。
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def splitDataSet(dataSet,axis,value): retDataSet = [] for featVec in dataSet: if featVec[axis] = = value: reducedfeatVec = featVec[:axis] reducedfeatVec.extend(featVec[axis + 1 :]) retDataSet.append(reducedfeatVec) return retDataSet |
axis表示划分数据集的特征,value表示特征的返回值。这里需要注意extend方法和append方法的区别。举例来说明这个区别
下面我们测试一下划分数据集函数的结果:
axis=0,value=1,按myDat数据集的第0个特征向量是否等于1进行划分。
接下来我们将遍历整个数据集,对每个划分的数据集计算香农熵,找到最好的特征划分方式
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def choosebestfeatureToSplit(dataSet): Numfeatures = len (dataSet) - 1 BaseShannonEnt = calcShannonEnt(dataSet) bestInfoGain = 0.0 bestfeature = - 1 for i in range (Numfeatures): featlist = [example[i] for example in dataSet] featSet = set (featlist) newEntropy = 0.0 for value in featSet: subDataSet = splitDataSet(dataSet,i,value) prob = len (subDataSet) / len (dataSet) newEntropy + = prob * calcShannonEnt(subDataSet) infoGain = BaseShannonEnt - newEntropy if infoGain>bestInfoGain: bestInfoGain = infoGain bestfeature = i return bestfeature |
信息增益是熵的减少或数据无序度的减少。最后比较所有特征中的信息增益,返回最好特征划分的索引。函数测试结果为
接下来开始递归构建决策树,我们需要在构建前计算列的数目,查看算法是否使用了所有的属性。这个函数跟跟第二章的calssify0采用同样的方法
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def majorityCnt(classlist): ClassCount = {} for vote in classlist: if vote not in ClassCount.keys(): ClassCount[vote] = 0 ClassCount[vote] + = 1 sortedClassCount = sorted (ClassCount.items(),key = operator.itemgetter( 1 ),reverse = True ) return sortedClassCount[ 0 ][ 0 ] def createTrees(dataSet,labels): classList = [example[ - 1 ] for example in dataSet] if classList.count(classList[ 0 ]) = = len (classList): return classList[ 0 ] if len (dataSet[ 0 ]) = = 1 : return majorityCnt(classList) bestfeature = choosebestfeatureToSplit(dataSet) bestfeatureLabel = labels[bestfeature] myTree = {bestfeatureLabel:{}} del (labels[bestfeature]) featValue = [example[bestfeature] for example in dataSet] uniqueValue = set (featValue) for value in uniqueValue: subLabels = labels[:] myTree[bestfeatureLabel][value] = createTrees(splitDataSet(dataSet,bestfeature,value),subLabels) return myTree |
最终决策树得到的结果如下:
有了如上的结果,我们看起来并不直观,所以我们接下来用matplotlib注解绘制树形图。matplotlib提供了一个注解工具annotations,它可以在数据图形上添加文本注释。我们先来测试一下这个注解工具的使用。
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import matplotlib.pyplot as plt decisionNode = dict (boxstyle = 'sawtooth' ,fc = '0.8' ) leafNode = dict (boxstyle = 'sawtooth' ,fc = '0.8' ) arrow_args = dict (arrowstyle = '<-' ) def plotNode(nodeTxt,centerPt,parentPt,nodeType): createPlot.ax1.annotate(nodeTxt,xy = parentPt,xycoords = 'axes fraction' ,\ xytext = centerPt,textcoords = 'axes fraction' ,\ va = 'center' ,ha = 'center' ,bbox = nodeType,\ arrowprops = arrow_args) def createPlot(): fig = plt.figure( 1 ,facecolor = 'white' ) fig.clf() createPlot.ax1 = plt.subplot( 111 ,frameon = False ) plotNode( 'test1' ,( 0.5 , 0.1 ),( 0.1 , 0.5 ),decisionNode) plotNode( 'test2' ,( 0.8 , 0.1 ),( 0.3 , 0.8 ),leafNode) plt.show() |
测试过这个小例子之后我们就要开始构建注解树了。虽然有xy坐标,但在如何放置树节点的时候我们会遇到一些麻烦。所以我们需要知道有多少个叶节点,树的深度有多少层。下面的两个函数就是为了得到叶节点数目和树的深度,两个函数有相同的结构,从第一个关键字开始遍历所有的子节点,使用type()函数判断子节点是否为字典类型,若为字典类型,则可以认为该子节点是一个判断节点,然后递归调用函数getNumleafs(),使得函数遍历整棵树,并返回叶子节点数。第2个函数getTreeDepth()计算遍历过程中遇到判断节点的个数。该函数的终止条件是叶子节点,一旦到达叶子节点,则从递归调用中返回,并将计算树深度的变量加一
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def getNumleafs(myTree): numLeafs = 0 key_sorted = sorted (myTree.keys()) firstStr = key_sorted[ 0 ] secondDict = myTree[firstStr] for key in secondDict.keys(): if type (secondDict[key]).__name__ = = 'dict' : numLeafs + = getNumleafs(secondDict[key]) else : numLeafs + = 1 return numLeafs def getTreeDepth(myTree): maxdepth = 0 key_sorted = sorted (myTree.keys()) firstStr = key_sorted[ 0 ] secondDict = myTree[firstStr] for key in secondDict.keys(): if type (secondDict[key]).__name__ = = 'dict' : thedepth = 1 + getTreeDepth(secondDict[key]) else : thedepth = 1 if thedepth>maxdepth: maxdepth = thedepth return maxdepth |
测试结果如下
我们先给出最终的决策树图来验证上述结果的正确性
可以看出树的深度确实是有两层,叶节点的数目是3。接下来我们给出绘制决策树图的关键函数,结果就得到上图中决策树。
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def plotMidText(cntrPt,parentPt,txtString): xMid = (parentPt[ 0 ] - cntrPt[ 0 ]) / 2.0 + cntrPt[ 0 ] yMid = (parentPt[ 1 ] - cntrPt[ 1 ]) / 2.0 + cntrPt[ 1 ] createPlot.ax1.text(xMid,yMid,txtString) def plotTree(myTree,parentPt,nodeTxt): numLeafs = getNumleafs(myTree) depth = getTreeDepth(myTree) key_sorted = sorted (myTree.keys()) firstStr = key_sorted[ 0 ] cntrPt = (plotTree.xOff + ( 1.0 + float (numLeafs)) / 2.0 / plotTree.totalW,plotTree.yOff) plotMidText(cntrPt,parentPt,nodeTxt) plotNode(firstStr,cntrPt,parentPt,decisionNode) secondDict = myTree[firstStr] plotTree.yOff - = 1.0 / plotTree.totalD for key in secondDict.keys(): if type (secondDict[key]).__name__ = = 'dict' : plotTree(secondDict[key],cntrPt, str (key)) else : plotTree.xOff + = 1.0 / plotTree.totalW plotNode(secondDict[key],(plotTree.xOff,plotTree.yOff),cntrPt,leafNode) plotMidText((plotTree.xOff,plotTree.yOff),cntrPt, str (key)) plotTree.yOff + = 1.0 / plotTree.totalD def createPlot(inTree): fig = plt.figure( 1 ,facecolor = 'white' ) fig.clf() axprops = dict (xticks = [],yticks = []) createPlot.ax1 = plt.subplot( 111 ,frameon = False , * * axprops) plotTree.totalW = float (getNumleafs(inTree)) plotTree.totalD = float (getTreeDepth(inTree)) plotTree.xOff = - 0.5 / plotTree.totalW; plotTree.yOff = 1.0 plotTree(inTree,( 0.5 , 1.0 ),'') plt.show() |
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原文链接:http://www.cnblogs.com/kl2blog/p/7763188.html